2013年12月5日 星期四

次世代高速基因定序 (Next Generation Sequencing)

犀利氏的生技專欄

生技股發燒,美國生技產業的最新發展: 次世代高速基因定序 (Next Generation Sequencing)




要簡單的了解生命科學,首先必須先了解我們昰如何發展成如此複雜的生命體?

所有生命體都必須仰賴貯存在染色體裡的DNA(ATCG)所構成的密碼,經由許多複雜的解密機制,最後發展成世界上多樣化而美麗的生命體。我們的日常行為:喜歡吃甚麼、會愛上哪種人、心理狀態、容易得到哪類疾病等,其實都記錄在我們的生命硬碟(DNA)裡。

以遺傳學的觀點來看,所有生物體的起源是基因,而部分生理、心裡上的疾病,都跟基因變異有關,例如癌症。為了治療癌症,科學家們努力了近三十年卻仍只有小小的進展,至今仍無法有效治癒癌症。所謂知己知彼,百戰百勝,為了治療疾病,必須徹底了解導致疾病發生的全基因體序列與其結構。



早期以Sanger定序人類全基因體序列耗費了近十年的時間,是相當龐大的人力及花費,因此難針對各種疾病做全基因體定序。在2001年時,將一個染色體DNA定序的花費昰1億美金(參考上圖),去年開始因為次世代基因定序技術(NGS)的成熟,花費降到1萬美金以下,並且幾天內就能知道結果,對定序科技來說,簡直就是從石器時代進化到太空科技。未來幾年內,我們就能全面快速取得及分析每個人身上各種疾病的基因體序列,未來配合藥物設計,可以進而達成個人化或是專一化的醫療時代,潛力無窮,只是未來牽涉到的道德、個人隱私層面就會很廣了。



在美國的生物科技公司理,市場上具有NGS的技術平台有三大品牌,LifeIllumina,與Roche。期中又以Illumina的市占率最大。由於目前NGS的費用逐年下降,使得NGS普及化漸漸露出曙光,對NGS在醫療的運用產生了無限的想像空間。IlluminaNasdaq的股價從2013年一月到目前為止已大漲了1倍之多。是相當值得注意的一個題材。新世代的基因定序晶片,台積電其實早就在生產了,只是要達到經濟規模還需要一段時間。以下附上Illumina的週線圖供參考:


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